医院创建于1957年，前身是中国科学院西郊门诊部，于1964年5月移交地方，正式更名为北京市中关村医院。时至今日，医院已发展成为一所由海淀区公共委、海淀区卫生局所属的集医、教、研、防为一体的二级甲等综合性医院，

医院位于中关村高科技园区核心区，建筑面积3.3万平方米，现有职工700余人，编制病床228张，设有临床科室8个、门诊科室18个，医技辅助科室9个，急诊、体检中心各1个，负责203个统筹合同单位、中国科学院23个科研所、600余名高知高干的医疗保健任务.医院是北京市全科医学社区培训基地;海淀区继续医学教育培训基地;北京医科大学护理学院本科生社区实习基地;此外还担负着海淀区卫生学校教学及院内实习任务。

医院注重医疗设备的引进和投资，拥有万元以上设备100余件，核磁共振、全身螺旋CT、数字化X线摄影机、C型臂X光机、彩色多普勒超声诊断仪、骨密度检测仪、全自动大型生化分析仪、多项肿瘤检测、高压氧舱等设备，有效地提高了临床诊断及辅助科室检查和治疗水平。