医院于2006年12月顺利通过了国际医院评审联合委员会的评审，成为中国大陆首家通过国际医院评审（JCI )的公立医院；2017年通过国际医疗信息化最高级别认证HIMSS7；2017年成为中国首家加入MAYO CLINIC医疗联盟的公立医院；2019年亚洲首家通过磁性医院认证。2013年1月，医院荣获“全国卫生系统先进集体”荣誉称号；2014—2018年，医院连续五年荣获“中国医疗机构最佳雇主”荣誉称号；2018年荣获“人文爱心医院”荣誉称号；2020年荣获浙江省人民政府质量创新奖；全国抗击新冠肺炎疫情先进集体、全国卫生系统先进集体等荣誉称号。2018年全国三级公立医院绩效考核国家监测考核结果排名，邵逸夫医院在全国2398家三级公立医院中居全国综合性医院第11名，进入全国参评医院仅有1%的A++序列；2019年度复旦大学医院管理研究所“中国医院综合排行榜”全国第78位，上升23位，科研学术得分8.28，位列全国第37位，上升64位，均为全国进步最快的医院。邵逸夫医院牵头建设国家呼吸区域医疗中心，共建综合类别国家区域医疗中心。