南京军区机关医院体检中心又称为南京军区司令部门诊部体检中心，创建于战火硝烟的1951年代，是具有62年建院历史的军中名院。医院位于六朝古都南京市龙蟠中路46号（华山饭店对面），地处南京市紫金山下，玄武湖边，是南京军区司令部直属甲级军队医院体检中心，南京市医保定点医院体检中心。多次被总后卫生部，国家卫生部，南京军区，南京军区司令部评为“先进妇科治疗单位”“军警民共建标兵单位”、“全军重点妇科”“医疗工作先进单位”、“杰出贡献医疗单位”、“计划生育先进单位”、“医疗技术过硬单位”、“白求恩式医院体检中心”。

南京军区机关医院体检中心拥有B（彩）超、全自动生化分析仪、血球计数仪、Hp呼吸测试仪、全自动血细胞分析仪、全自动生化分析仪、血凝仪、酶标仪、洗板机、细菌培养室、药敏试验室、日本奥林帕斯高倍电子显微镜等。