体检部设有内科、外科、妇产科、眼科、耳鼻喉科、口腔科等临床科室,设有放射科、B超室、检验科、心电图室、红外线乳腺扫描等医技科室。拥有PET—CT、3TMR、最先进的双源CT、全自动血生化、血尿常规分析仪、彩色多普勒超声仪、西门子X光机、VIZ-RMC型近红外线乳腺扫描仪及日本NEC-3321全自动同步十二导联智能心电图等先进的医疗设备。
开展各种招工、就业、教师、学生、海员、外宾等个人体检,各种单位、公司、部队、公务员、离退干部等团体体检,并承担市级领导和厅、局级领导的干部体检,承担厦门市高招、征兵体检的总检,中心热忱提供按政府部门相关规定条件上门服务。本体检部的体检结果均存入电脑软件,设立个人健康档案,跟踪服务。开展专家健康咨询、解释检验报告,提出治病、防病和养生保健的建议。